"(RapidMiner - 5.1.11) (R - 2.13.1)安装问题- Mac OSX Lion(已解决)"
leiterenato
成员职位:6
因素二世
嗨,专家,
我知道在论坛中重复一个主题不是一个好的做法，但我刚刚放弃了尝试使RapidMiner + R扩展工作。=（
所以，事情是这样的:
操作系统及硬件
Mac OSX Lion (10.7.1)
-酷睿i5
软件版本(全部64位)
RapidMiner v5.1.11
R - v2.13.1
Java - v1.6.0_26
环境变量
回声路径美元
/ opt /地方/ bin: / opt /地方/ sbin: / usr / bin: / bin: / usr / sbin: / sbin: / usr /地方/ bin: / usr / X11 / bin: /图书馆/框架/ x86_64 / R.framework /库
==>在这里我可以访问libR。在PATH中使用dylib。以下是我能看到的文件:
ls /图书馆/框架/ x86_64 / R.framework /库
libR。dylib libRblas。dylib libRlapack.dylib
echo $ R_HOME
/图书馆/框架/ R.framework /版本/ 2.13 /资源乐鱼体育安装
在这个文件夹中，我可以访问R可执行文件和其他一些R安装文件夹。查看ls命令的输出:
ls /图书馆/框架/ R.framework /版本/ 2.13 /资源乐鱼体育安装
复制NEWS.pdf SVN-REVISION等库模块
信息。plist R bin fontconfig库共享
Rscript文档包含man1
echo $ JAVA_HOME
/图书馆/ Java / Home
==> Java安装文件夹。查看ls命令的输出:
ls /图书馆/ Java / Home
Bin bundle lib man
为了创建这个环境变量，我使用了一个。plist文件(~/.MacOSX/environment.plist)，如下所示:
<？xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<！文档类型plist公共"-//苹果//DTD plist 1.0//EN" "http://www.apple.com/DTDs/PropertyList-1.0.dtd" >
< plist version = " 1.0 " >
< dict >
关键> < JAVA_HOME关键> < /
<字符串> /图书馆/ Java / Home / <字符串>
<键> R_HOME关键> < /
<字符串> /图书馆/框架/ R.framework /版本/ 2.13 /资源字符串> < /乐鱼体育安装
<关键>路径> < /关键
<字符串> /图书馆/框架/ R.framework /图书馆/ x86_64 / <字符串>
< / dict >
< / plist >
所以，每次我打开我的笔记本电脑，打开一个终端，输入“env”，所有的环境变量都在那里。
在准备好环境后，我解压缩文件夹“rapidminer”，并尝试以以下方式启动它:
终端
$java -jar lib/rapidminer.jar
以下主要信息:
2011年9月14日晚上10:08:18 org.rosuda.JRI.Rengine loadLibrary
INFO: Successfully loaded R library from /library/ Frameworks/R.framework/Versions/2.13乐鱼体育安装/Resources/library/rJava/jri/libjri.jnilib(true)
.．.
[致命错误]:1:1:不允许在prolog中显示内容。
.．.
9月14日，2011年10:08:21 PM com.rapidminer.operator.r.ROperatorFactory readoperatorfragments
警告:无法从'file:/Users/leiterenato/Documents/Projetos/Analytic/System/Tools/Rapid-i/rapidminer/lib/'中读取R片段，错误:prolog中不允许包含内容。
saxparseexception: prolog中不允许包含内容。
[致命错误]:1:1:不允许在prolog中显示内容。
.．.
[致命错误]connections.xml:1:1:文件过早结束。
9月14日，2011年10:08:21 PM com.rapidminer.tools.jdbc.connection.DatabaseConnectionService init
警告:读取数据库连接文件失败:org.xml.sax.SAXParseException:文件过早结束。
saxparseexception:文件过早结束。
com.sun.org.apache.xerces.internal.parsers.DOMParser.parse (DOMParser.java: 249)
com.sun.org.apache.xerces.internal.jaxp.DocumentBuilderImpl.parse (DocumentBuilderImpl.java: 284)
javax.xml.parsers.DocumentBuilder.parse (DocumentBuilder.java: 208)
com.rapidminer.io.process.XMLTools.parse (XMLTools.java: 179)
com.rapidminer.tools.jdbc.connection.DatabaseConnectionService.init (DatabaseConnectionService.java: 92)
com.rapidminer.RapidMiner.init (RapidMiner.java: 474)
com.rapidminer.gui.RapidMinerGUI.run (RapidMinerGUI.java: 221)
com.rapidminer.gui.RapidMinerGUI.launch (RapidMinerGUI.java: 505)
com.rapidminer.gui.RapidMinerGUI.main (RapidMinerGUI.java: 488)
ARGUMENT ` LANGUAGE=en ` __ignored__
==>此处RAPID|MINER启动器屏幕冻结。我必须强制退出应用程序!
-这个“prolog”错误是什么?与文件夹权限相关的东西吗?
-我也做了一个CHMOD 750 rapidminer.jar。
我想我阅读了所有关于这方面的主题，并试图实现其他解决方案。
他们都没能成功。=（
如果我不安装R扩展，一切工作完美!
有人知道发生了什么吗?
提前谢谢!
最好的问候,
雷纳托
我知道在论坛中重复一个主题不是一个好的做法，但我刚刚放弃了尝试使RapidMiner + R扩展工作。=（
所以，事情是这样的:
操作系统及硬件
Mac OSX Lion (10.7.1)
-酷睿i5
软件版本(全部64位)
RapidMiner v5.1.11
R - v2.13.1
Java - v1.6.0_26
环境变量
回声路径美元
/ opt /地方/ bin: / opt /地方/ sbin: / usr / bin: / bin: / usr / sbin: / sbin: / usr /地方/ bin: / usr / X11 / bin: /图书馆/框架/ x86_64 / R.framework /库
==>在这里我可以访问libR。在PATH中使用dylib。以下是我能看到的文件:
ls /图书馆/框架/ x86_64 / R.framework /库
libR。dylib libRblas。dylib libRlapack.dylib
echo $ R_HOME
/图书馆/框架/ R.framework /版本/ 2.13 /资源乐鱼体育安装
在这个文件夹中，我可以访问R可执行文件和其他一些R安装文件夹。查看ls命令的输出:
ls /图书馆/框架/ R.framework /版本/ 2.13 /资源乐鱼体育安装
复制NEWS.pdf SVN-REVISION等库模块
信息。plist R bin fontconfig库共享
Rscript文档包含man1
echo $ JAVA_HOME
/图书馆/ Java / Home
==> Java安装文件夹。查看ls命令的输出:
ls /图书馆/ Java / Home
Bin bundle lib man
为了创建这个环境变量，我使用了一个。plist文件(~/.MacOSX/environment.plist)，如下所示:
<？xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<！文档类型plist公共"-//苹果//DTD plist 1.0//EN" "http://www.apple.com/DTDs/PropertyList-1.0.dtd" >
< plist version = " 1.0 " >
< dict >
关键> < JAVA_HOME关键> < /
<字符串> /图书馆/ Java / Home / <字符串>
<键> R_HOME关键> < /
<字符串> /图书馆/框架/ R.framework /版本/ 2.13 /资源字符串> < /乐鱼体育安装
<关键>路径> < /关键
<字符串> /图书馆/框架/ R.framework /图书馆/ x86_64 / <字符串>
< / dict >
< / plist >
所以，每次我打开我的笔记本电脑，打开一个终端，输入“env”，所有的环境变量都在那里。
在准备好环境后，我解压缩文件夹“rapidminer”，并尝试以以下方式启动它:
终端
$java -jar lib/rapidminer.jar
以下主要信息:
2011年9月14日晚上10:08:18 org.rosuda.JRI.Rengine loadLibrary
INFO: Successfully loaded R library from /library/ Frameworks/R.framework/Versions/2.13乐鱼体育安装/Resources/library/rJava/jri/libjri.jnilib(true)
.．.
[致命错误]:1:1:不允许在prolog中显示内容。
.．.
9月14日，2011年10:08:21 PM com.rapidminer.operator.r.ROperatorFactory readoperatorfragments
警告:无法从'file:/Users/leiterenato/Documents/Projetos/Analytic/System/Tools/Rapid-i/rapidminer/lib/'中读取R片段，错误:prolog中不允许包含内容。
saxparseexception: prolog中不允许包含内容。
[致命错误]:1:1:不允许在prolog中显示内容。
.．.
[致命错误]connections.xml:1:1:文件过早结束。
9月14日，2011年10:08:21 PM com.rapidminer.tools.jdbc.connection.DatabaseConnectionService init
警告:读取数据库连接文件失败:org.xml.sax.SAXParseException:文件过早结束。
saxparseexception:文件过早结束。
com.sun.org.apache.xerces.internal.parsers.DOMParser.parse (DOMParser.java: 249)
com.sun.org.apache.xerces.internal.jaxp.DocumentBuilderImpl.parse (DocumentBuilderImpl.java: 284)
javax.xml.parsers.DocumentBuilder.parse (DocumentBuilder.java: 208)
com.rapidminer.io.process.XMLTools.parse (XMLTools.java: 179)
com.rapidminer.tools.jdbc.connection.DatabaseConnectionService.init (DatabaseConnectionService.java: 92)
com.rapidminer.RapidMiner.init (RapidMiner.java: 474)
com.rapidminer.gui.RapidMinerGUI.run (RapidMinerGUI.java: 221)
com.rapidminer.gui.RapidMinerGUI.launch (RapidMinerGUI.java: 505)
com.rapidminer.gui.RapidMinerGUI.main (RapidMinerGUI.java: 488)
ARGUMENT ` LANGUAGE=en ` __ignored__
==>此处RAPID|MINER启动器屏幕冻结。我必须强制退出应用程序!
-这个“prolog”错误是什么?与文件夹权限相关的东西吗?
-我也做了一个CHMOD 750 rapidminer.jar。
我想我阅读了所有关于这方面的主题，并试图实现其他解决方案。
他们都没能成功。=（
如果我不安装R扩展，一切工作完美!
有人知道发生了什么吗?
提前谢谢!
最好的问候,
雷纳托
0
答案
我想出了如何使R扩展(v2.13.1 -最新版本)在MacOSX Lion(10.7.1)中与RapidMiner (v5.1.11 -最新版本)一起工作!
在尝试了几种解决方案后，我结合了其他帖子的一些想法来解决这个问题。
操作系统及硬件
Mac OSX Lion (10.7.1)
-酷睿i5
- MacBook Air 13”和MacMini Server
软件版本(全部64位)
RapidMiner v5.1.11
R - v2.13.1
Java - v1.6.0_26
MySQL - 5.5.16
安装过程
1)安装MySQL - v5.5.16(这不是让R Extension工作所必需的)
- MySQL (www.mysql.com)
2)安装R - v2.13.1
- r (http://cran.r-project.org)
3)从R网站安装TclTk包
- TclTk (http://cran.r-project.org/bin/macosx/tools/)
你必须这么做。这个包的缺失是我无法启动RapidMiner的原因。
4)安装R包。打开R命令行，输入以下命令来安装每个包。
install.packages(“rJava”)
#你必须安装这个包。
install.packages(“JavaGD”)
# JavaGD包允许R Extension绘制图形。如果没有这个，在尝试绘制内容时会出现错误。
install.packages(“RMySQL”)
这个包在连接MySQL数据库时非常有用。
5)环境变量
我尝试了至少6种不同的解决方案。Bashrc， .profiles， .plist, export, setenv，等等…)!我发现了一个很好的解决方案，你根本不必用文件或在终端中重复命令来脏你的SO。
只是一个观察……当我试图创建一个.plist文件(~/. macosx /environment.plist)时，变量被导出，但它阻止了该文件夹或文件从任何程序访问。
解决方案是EXPORT命令!(是的，这是真的)。
但是为了避免每次你想要执行RapidMiner时都需要打开终端并导出变量，让我们使用Automator应用程序(在任何Mac OSX Lion中本机用于创建程序)。很简单的…
-打开Automator.app
-选择创建“应用程序”
-在最左边的一列，选择“Utilities”(库中的一个子项目)
-在第二列中，选择“运行Shell脚本”
-双击它
-在出现的窗口中，选择(在左侧)“shell: /bin/bash”和右边的“Pass input: as arguments”
—在文本区域粘贴如下内容。
导出路径= $路径:/图书馆/框架/ R.framework /版本/ 2.13 /资源/ bin: /图书馆/框架/ R.fr乐鱼体育安装amework /版本/ 2.13 /资源/图书馆/ rJava / jri: /图书馆/框架/ x86_64 / R.framework /库
导出R_HOME=/Library/Frameworks/R.framework/Resou乐鱼体育安装rces(这是安装R的地方)
export RAPIDMINER_HOME=/subfolders_where_is_rapidminer/rapidminer(例如:/Users/foo/rapidminer)
export JAVA_HOME=/subfolder_where_is_your_JAVA_HOME(例如:/Library/Java/Home)
cd / subfolders_where_is_rapidminer / rapidminer / lib
Java -jar rapidminer.jar
在PATH变量中，我把路径放在:
.bin文件或R (/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.13/Resourc乐鱼体育安装es/bin)
.JRI库文件(/ library/ Frameworks/R.framework/Versions/2.13/Resources/乐鱼体育安装library/rJava/jri)
.R库文件64位(/Library/Frameworks/R.framework/Libraries/x86_64)
—保存为:name_choosen_by_you
与，文件格式:应用程序。
完成:这样你就有了一个干净的解决方案来执行你的RapidMiner。
我在我的MacBook Air和MacMini Server上测试了这个解决方案，效果很好。
！！!请注意! !
在安装了R扩展的RapidMiner后，我尝试直接在TERMINAL中运行相同的导出命令，看看是否有任何其他警告。
==>请，安装你的RapidMiner和R扩展后，帮助我找出这些其他警告(我为此创建了另一个帖子)…
http://rapid-i.com/rapidforum/index.php/topic,4138.0.html
我非常感谢开发团队的任何人为我们翻译警告。
拜托，反馈是非常重要的!
谢谢大家。
雷纳托雷特