医疗保健数据仓库

DocMusher

亲爱的RM朋友们:

2016年，我们在PLOSOne上发表了一篇论文，展示了RM在使用Radoop的Hive服务器的专用Hadoop集群中集成、使用、分析大型医疗数据库(MIMIC-III)等方面的潜力。

https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0145791

这篇论文被引用了几次，超过7000人阅读了“RapidMiner”(指标作为附件PlosOneRM.docx)。

此外，我们的研究在麻省理工学院进行了展示。

https://www.slideshare.net/svenvanpoucke1/rapidminer-an-entrance-to-explore-mimiciii

基于当前的RM技术和对医疗记录的二次分析的不断增长的需求，我想研究如何使用下面博客中描述的相同数据库。

https://aws.amazon.com/blogs/big-data/build-a-healthcare-data-warehouse-using-amazon-emr-amazon-redshift-aws-lambda-and-omop/

对你的反馈很感兴趣，我来自比利时的问候

斯文

MartinLiebig

斯文,

AWS资源通常只在RM Studio中使用。这意味着您可以直接连接到S3和Redshift资源。此外，可以在AWS上托管RM服务器基础设施，以便更靠近源。

BR,
马丁

DocMusher

马丁,

谢谢你的反馈。激活我的神经突触看看我能不能做到。无论如何，如果任何社区成员有兴趣加入，我将很高兴

干杯

斯文

sgenzer

嗨，斯文——是的，正如马丁所说，RM与AWS资源配合得非常好。乐鱼体育安装你的项目很容易看起来像这样:



如果您在AWS上有我可以乐鱼体育安装使用的资源，我很乐意提供帮助。

斯科特

DocMusher

你好,斯科特,
我正在通读https://aws.amazon.com/blogs/big-data/build-a-healthcare-data-warehouse-using-amazon-emr-amazon-redshift-aws-lambda-and-omop/
等待麻省理工学院的更多信息，我是如何登录MIMIC-III AMI的。
我一得到他们的反馈就给你回复。
我正在调查https://s3.amazonaws.com/physionet-pds/index.html
谢谢
斯文

sgenzer

嗨@DocMusher所以我做了更多的阅读，老实说，更简单的方法可能是Python与wfdb库https://github.com/MIT-LCP/wfdb-python

我把一个快速的样本到执行Python，我可以从wfdb得到一个响应。它没有格式化或任何东西…只是显示数据连接。

<？xml version="1.0" encoding="UTF-8"?   
             

无论如何，我不是Python大师，但如果你需要帮助，这里有很多人都是……

斯科特

Nikouy

嗨@mschmitz，

你知道Rapidminer是如何与reddhisft或Azure数据湖交互的吗?是否将数据下载并加载到RAM中进行分析?

谢谢